藻体为单细胞或相连成群体。细胞的壳面呈线形、椭圆形、菱形、舟形、新月形、弓形、“S”形、棒形等，其形态基本上属于长形至椭圆形。具壳缝或假壳缝，或具管壳缝，在壳缝或假壳缝的两侧具有由细点连成的横线纹，或具横肋纹。带面多数为长方形，通常无间生带。色素体盘状，多数，或片状1～2个。繁殖方式为细胞分裂和形成复大孢子。本纲种类比中心纲多，且大多数种类生活在淡水中。
本纲种类根据壳缝的有无及结构的变化，分为5个目。
羽纹硅藻纲分目检索表
1（2）细胞壳面具假壳缝…………………………………………………无壳缝目（Araphidiales）
2（1）细胞壳面具壳缝，或一面具壳缝另一面具假壳缝。
3（4）细胞仅一面具壳缝，另一面具假壳缝………………………单壳缝目（Monoraphidinales）
4（3）细胞两壳面均具壳缝。
5（8）壳缝发达。
6（7）壳缝线形…………………………………………………………双壳缝目（Biraphidinales）
7（6）壳缝发育成管壳缝………………………………………管壳缝目（Aulonoraphidinales）
8（5）壳缝不发达，很短，仅位于壳面两端的一侧……………………短壳缝目（Raphisionales）
（一）无壳缝目（Araphidiales）
细胞壳面仅有由横线纹构成的假壳缝，而没有真正的壳缝。单细胞或连成带状或星状群体。壳面通常为线形或披针形。常具间生带和隔片。淡水、海水中均有分布，营着生生活或浮游生活。
无壳缝目分属检索表
1（10）细胞内无隔片。
2（3）细胞两端从壳环面观大小相差很大（少数除外）…………………星杆藻属（Asterionella）
3（2）细胞两端基本相似，或略有大小。
4（7）细胞棍形，直或稍弯。壳面线形。
5（6）细胞两端略有大小………………………………………………海毛藻属（Thalassinthrix）
6（5）细胞两端相似…………………………………………………………海线藻属（Thalassionema）
7（4）壳面直线形或狭披针形以至椭圆形。壳环面长方形。
8（9）在生活状态下，细胞常连成长带状群体。…………………………脆杆藻属（Fragilaria）
9（8）在生活状态下，细胞常簇生呈放射状群体……………………………针杆藻属（Synedra）
10（1）细胞内有隔片。
11（12）细胞具横隔片。细胞两端等宽，两侧及两端对称…………………等片藻属（Diatoma）
12（11）细胞具纵隔片。隔片与壳面平行。
13（14）隔片波状………………………………………………………斑条藻属（Grammatophora）
14（13）隔片不呈波状。
15（16）细胞两端不等大。隔片只在粗大的一段………………………楔形藻属（Licmophora）
16（15）细胞两端大小相同。隔片直，壳面棒状，通常两端及中央略膨大………………………………………………………………………………平板藻属（Tabellaria）
无壳缝目常见属如下。
1.星杆藻属（Asterionella）
藻体细胞呈棒状，两端常膨突且往往大小不等，如图1-5-10所示。细胞常以一端相连成星状、螺旋状群体。壳面具有细致的线纹，假壳缝较窄。营浮游生活，淡水、海水中皆有分布。
2.针杆藻属（Synedra）
藻体细胞壳面线形、披针形或针形，多数种类中部至两端略渐窄，如图1-5-11所示。壳面中央常有方形或长方形的无纹区。具假壳缝，假壳缝两侧具横线纹或点纹。壳环面长方形，具明显的线纹。浮游种类单独生活，或形成放射状群体；着生种类为放射状或扇状群体。分布广，淡水、海水中皆有，主要生长在沟渠、池塘和湖泊中，浮游或着生在沿岸沉水植物、丝状藻类上，或着生在流水处的岩石或木头上。
图1-5-10 星杆藻属
图1-5-11 针杆藻属
3.脆杆藻属（Fragilaria）
藻体细胞壳面细长披针形、梭形、椭圆形，两侧对称，有的中部向两侧膨凸或凹入，两端逐渐狭窄，末端钝圆，具线形假壳缝，假壳缝两侧具细的横线纹或粗的点纹，如图1-5-12所示。带面长方形，常有间生带。细胞常以壳面相互连成带状群体，或以每个细胞的一端相连成“Z”形群体。种类多，主要分布于淡水中，常见于水沟、池塘、缓流的江河和湖泊等处。
图1-5-12 脆杆藻属
4.平板藻属（Tabellaria）
藻体细胞壳面呈棒形或线形，中部常明显膨大，两端略膨大，如图1-5-13所示。假壳缝狭窄，两侧具有由细点组成的线纹。壳环面常具有许多间生带，间生带之间具纵隔片。细胞常连成“Z”形或星形的群体，为池塘、湖泊以及缓流的小河中的浮游硅藻。
5.等片藻属（Diatoma）
藻体细胞壳面呈披针形或线形、棒形至椭圆形，有的种类两端略膨大，如图1-5-14所示。带面呈长方形，有间生带和横隔片，并有横肋纹。细胞常连接成带状或锯齿状群体。多数淡水产，少数海产。
图1-5-13 平板藻属
图1-5-14 等片藻属
（二）单壳缝目（Monoraphidinales）
藻体细胞的两个壳面中仅有一个壳面上具有真壳缝，而另一个壳面上仅具有由横线纹构成的假壳缝。
单壳缝目分属检索表
1（2）单细胞，壳的横轴弯曲，壳面宽椭圆形，不具胶质柄…………………卵形藻属（Cocconeis）
2（1）常为群体，壳的纵轴弯曲，壳面线形或披针形，具胶质柄，壳面两端大小相等，壳缝及假壳缝直………………………………………………………………………曲壳藻属（Achnanthes）
1.卵形藻属（异壳硅藻属）（Cocconeis）
藻体单细胞，壳面呈宽卵形、椭圆形或近圆形，如图1-5-15所示。上壳具有假壳缝，下壳为真壳缝，并有中央结和极节。带面在横轴方向或弧形或屈膝形弯曲，无间生带。色素体片状一个，位于上壳。分布于海水或淡水中，多营附着生活，浮游种类较少，以下壳贴附在大型藻类、沉水植物及丝状藻类上。
图1-5-15 卵形藻属
2.曲壳藻属（弯杆硅藻属）（Achnanthes）(www.xing528.com)
藻体细胞壳面呈披针形、长椭圆形、纺锤形或棒形，单细胞或相连成链状群体，或以胶质柄附着在它物上，如图1-5-16所示。上壳面只有假壳缝，下壳面具壳缝和结节。壳面纵轴弯曲，壳环面屈膝形。生活于海水、半咸水和淡水中，有的种类是鲍鱼的好饵料，有的则是危害紫菜的硅藻之一。
图1-5-16曲壳藻属
（三）双壳缝目（Biraphidinales）
细胞上下壳面均具有壳缝，壳缝位于壳面正中线或偏于一侧，或位于边缘，呈直线形、“V”形或“S”形。
双壳缝目分属检索表
1（14）细胞壳面两端及两侧均对称。
2（3）壳上有龙骨点，壳缝“S”形…………………………………………茧形藻属（Amphiprora）
3（2）壳上没有龙骨点。
4（7）壳面呈“S”形弯曲，壳缝“S”形。
5（6）壳面具十字形的点条纹…………………………………………布纹藻属（Gryrosigma）
6（5）壳面点条纹斜列……………………………………………………曲舟藻属（Pleurosigma）
7（4）壳面不弯曲，直。
8（9）壳缝两侧具由中央节延长的凸起，凸起外侧具线形至披针形的纵沟……………………………………………………………………………双壁藻属（Diploneis）
9（8）壳缝两侧无上述凸起，无纵沟。
10（11）壳面具平滑的横肋纹，或1～2条纵线纹…………………………羽纹藻属（Pinnularia）
11（10）壳面无横肋纹，亦无纵线。
12（13）中央节横伸成侧节。壳面有大而长的珠状纹…………………粗纹藻属（Trachyneis）
13（12）中央节球形。壳面具横线纹或横点纹……………………………舟形藻属（Navicula）
14（1）细胞壳面不对称。
15（18）细胞壳面两侧不对称。
16（17）壳面凸起，带面观两侧外凸…………………………………………双眉藻属（Amphora）
17（16）壳面扁平，带面观两侧平行………………………………………桥弯藻属（Cymbella）
18（15）细胞壳面两端不对称，一端较它端为大…………………异极藻属（Gomphonemaceae）
双壳缝目常见属如下。
1.舟形藻属（纺锤硅藻属）（Navicula）
壳面呈纺锤形或椭圆形，两端渐尖，如图1-5-17所示。细胞三轴都是对称的。壳缝直，位于中线上，中央节和极节大多明显。壳面花纹由点纹或线纹组成，位于中央节处的，常呈放射状排列。带面观呈长方形，无花纹。本属绝大多数为单细胞，种类极多，淡水、半咸水和海水中均有分布。
2.羽纹藻属（Pinnularia）
藻体单细胞或连成丝状群体。细胞壳面两侧基本平行，或中间略大两端圆，呈圆棒状或长椭圆形，如图1-5-18所示。壳面具横的、平行的肋纹，中轴区宽，有时超过壳面的1/3，壳缝直或弯曲。带面呈长方形。本属种类很多，多分布于淡水的浅水水体中。
图1-5-17 舟形藻属
图1-5-18 羽纹藻属
3.布纹藻属（双缝藻属）（Gyrosigma）
细胞壳面呈“S”形，从中部向两端逐渐尖细，末端尖或钝圆，如图1-5-19所示。中轴区狭，呈“S”形，中央节处略膨大；壳缝呈“S”形弯曲，具有小的中央节和极节。壳面花纹为由纵横线纹十字形交叉构成的布纹。带面为宽披针形。为淡水、半咸水或海水中的浮游硅藻。
4.曲舟藻属（Pleurosigma）
壳面线形或箭形，但总是“S”形。壳缝在中线上或偏于一侧。壳面花纹为点条纹斜列和横列交叉形成的锉刀眼花纹，如图1-5-20所示。中央节常小而圆。壳环面狭，有时呈弓形或扭转或中部收缩。为半咸水或海水种类，淡水中极少。
图1-5-19 布纹藻属
图1-5-20 曲舟藻属
5双壁藻属（Diploneis）
壳面多数呈椭圆形，少数为线形或提琴形，如图1-5-21所示。壳缝直，壳缝两侧具由中央节侧缘延长而形成的角状凸起，角状凸起的外侧具宽的或窄的纵沟，纵沟的外侧是横肋纹或由点纹连成的横线纹。带面呈长方形。此属海产种类较多，在淡水和半咸水的浅水区亦常见。
6.桥弯藻属（新月硅藻属）（Cymbella）
藻体单细胞，或以胶质柄附着在它物上，或埋于胶质管中。壳面两侧不对称，呈半月形、扁舟形或近舟形。壳缝偏向腹侧，直或弧状弯曲，如图1-5-22所示。有明显的中轴区和中心区。壳面花纹为点线纹、线纹或肋纹。本属是典型的淡水种类，少数生活于半咸水中。
图1-5-21 双壁藻属
图1-5-22 桥弯藻属
7.异极藻属（异端藻属）（Gomphonema）
细胞常生长在叉状分枝的胶质柄上，营固着生活，有时从胶质柄上脱落，成为偶然性的单细胞浮游种类。壳面披针形或棒状，两端不等大，两侧对称，中轴区狭窄，直，如图1-5-23所示。壳缝位于中轴区的中央。壳面花纹由粗点纹或细点纹组成，略呈放射状排列。壳环面多为楔形，末端为截形。多为淡水产，海水种类较少。
图1-5-23 异端藻属
（四）管壳缝目（Aulonoraphidinales）
两壳都具有管壳缝，管壳缝位于壳面一侧或两侧边缘的凸起（龙骨突）内，管壳缝管壁上有许多圆孔（龙骨点）与细胞内部相通。
管壳缝目常见属如下。
1.菱形藻属（偏缝硅藻属）（Nitzschia）
细胞细长，壳面为直纺锤形、“S”形、椭圆形等，两端渐尖，如图1-5-24所示。壳面一侧有龙骨突，上下壳的龙骨突不在同一侧，因此细胞壁的断面为菱形。在龙骨突中有管壳缝，又沿着管壳缝有一列小圆孔列（龙骨点）。常为单细胞，少数种类形成群体或细胞位于单一或分枝的胶质管中。种类很多，分布于淡水、半咸水和海水中，营浮游生活或附着在它物上。
2.双菱藻属（Surirella）
藻体细胞壳面呈长椭圆形或卵形，有时中部缢缩，如图1-5-25所示。壳面平直或螺旋状扭曲，两侧缘具龙骨突，其内有管壳缝。管壳缝有筒状管道与细胞内部相通，所以壳面呈肋条状。带面呈细长形或楔形。种类多，单细胞，营真性浮游生活，多分布在热带、亚热带的淡水、半咸水和海水中。
图1-5-24 菱形藻属
图1-5-25 双菱藻属
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