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GPU加速下的稀疏矩阵形式

时间:2023-11-24 理论教育 版权反馈
【摘要】:对于稀疏矩阵的处理,使用MATLAB中的“稀疏矩阵形式”是一种很好的想法。稀疏矩阵形式的运行效率由矩阵的稀疏度决定,即矩阵中零元素越多,矩阵运算速度越快。如果一个矩阵几乎不稀疏,那么使用稀疏矩阵形式,将不会带来速度的提升和内存的节省。在例子DenseSparse.m中,尝试将密集矩阵转换为稀疏矩阵sp_denseA),稀疏矩阵形式的运算比密集矩阵花费了更多时间。然而在例子RealSparse.m中,稀疏矩阵形式的速度提高了很多。

GPU加速下的稀疏矩阵形式

对于稀疏矩阵(大部分元素是零的大规模矩阵)的处理,使用MATLAB中的“稀疏矩阵形式”是一种很好的想法。对于非常大的矩阵,因为只需存储非零元素,所以稀疏矩阵所需内存更少,而且运算过程中不考虑零元素,运算速度也更快。

创建稀疏形式矩阵的简易方法如下:

或者简单地使用内置指令sparse将全矩阵转化为稀疏矩阵

所有MATLAB内置运算都适用于稀疏矩阵形式,无需进行任何修改,而且稀疏矩阵的运算结果也是稀疏矩阵形式。(www.xing528.com)

稀疏矩阵形式的运行效率由矩阵的稀疏度决定,即矩阵中零元素越多,矩阵运算速度越快。如果一个矩阵几乎不稀疏,那么使用稀疏矩阵形式,将不会带来速度的提升和内存的节省。

在例子DenseSparse.m中,尝试将密集矩阵(A:5000×5000)转换为稀疏矩阵sp_denseA),稀疏矩阵形式的运算比密集矩阵花费了更多时间。然而在例子RealSparse.m中,稀疏矩阵形式的速度提高了很多。函数sprand(5000,2000,0.2)用于生成5000×2000的稀疏矩阵。第三个参数0.2意味着,在生成的矩阵中大约20%的元素为非零元素,其他80%的元素为零元素。在矩阵运算中,即使有20%的非零元素,稀疏矩阵也能够获得非常大的速度提升。

观察每个矩阵所需的内存大小(如下所示),稀疏形式的稀疏矩阵(sp_A2)比全矩阵(80MB)需要更少的内存(大约29MB)。然而稀疏形式的密集矩阵(sp sp_denseA)比全矩阵(80MB)需要更多的内存(大约160MB),这是因为稀疏矩阵形式需要更多的内存来存储矩阵的索引信息。

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