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蜘蛛丝蛋白:结构、动力学及人工仿制研究

时间:2023-06-15 理论教育 版权反馈
【摘要】:蜘蛛丝是由蛋白质,也就是20种氨基酸组成的。雌性蜘蛛有7个腺体,雄性蜘蛛有6个腺体,每个腺体分泌一种特定的蜘蛛丝蛋白,不同丝蛋白的氨基酸组成是完全不一样的,因此性能也不一样。对于做应用的人来说,更关心的是蜘蛛丝的机械性能或者力学性能。我们比较了三种蜘蛛丝蛋白、蚕丝蛋白、高强度钢、碳纤维和高分子材料等的性质。金圆网蛛丝蛋白基因序列的鉴定。丝蛋白的二级、三级结构解析,分析丝蛋白的高水溶性。

蜘蛛丝蛋白:结构、动力学及人工仿制研究

相信大家都看过电影蜘蛛侠》,电影中的蜘蛛侠发射出的蜘蛛丝强度高、弹性大,功能非常强大。现实中的蜘蛛丝真的有这么神奇吗?其实远没有电影中的那么神奇,但从材料学来讲,蜘蛛丝的一些性能比现有的各种材料都强很多。

1)蜘蛛网的组成和性能

蜘蛛的肚子上总吊着一根径向的丝,也叫生命线。织网的时候,蜘蛛利用周围的环境先搭出一个框架,再在框架上分泌不同的物质。蜘蛛网由径向和环状两部分组成,径向和环状的蜘蛛丝由不同的腺体分泌,材料性质也不一样,两者之间有连接点,类似于胶水,将径向和环状的丝粘连起来。蜘蛛丝是有黏性的,将蜘蛛丝放大能看到丝上有一个个圆球,蜘蛛知道在哪里吐并且不把自己黏住,分泌黏性圆球的目的是:①黏住猎物,再分泌一种特殊的物质包裹猎物,避免猎物逃跑;②雌性蜘蛛产卵,避免被吃掉,会分泌类似蚕茧的东西包裹。

蜘蛛丝是由蛋白质,也就是20种氨基酸组成的。雌性蜘蛛有7个腺体,雄性蜘蛛有6个腺体,每个腺体分泌一种特定的蜘蛛丝蛋白,不同丝蛋白的氨基酸组成是完全不一样的,因此性能也不一样。

对于做应用的人来说,更关心的是蜘蛛丝的机械性能或者力学性能。我们比较了三种蜘蛛丝蛋白、蚕丝蛋白、高强度钢、碳纤维高分子材料等的性质。可以看出,在相同的直径下,蜘蛛牵引丝的强度和高强度钢的强度是一样的,但钢材的密度是蜘蛛牵引丝的6倍,而且钢材的延伸度只有0.8%,而鞭毛样蜘蛛丝的延伸度可达270%。蜘蛛分泌的不同蜘蛛丝有不同的强度、硬度、延伸度等,最惊奇的是通常认为有机分子是不导热的,而蜘蛛牵引丝的导热性能跟铜差不多,比钢材的导热性还好。

正因为蜘蛛丝的这些很特别的性质,它被认为是非常有应用前景的、可再生的、没有环境污染的材料。潜在的应用有军事上的防弹背心,航空母舰的燃阻材料、大型降落伞、高空飞机、人造韧带、电子元器件,等等。

既然蜘蛛丝有如此强大的功能,为什么不能像蚕丝一样大量生产呢?蚕丝在几千年前已经靠养殖实现了大量生产,而蜘蛛的行为与蚕不一样,蜘蛛有争夺领土、吃同类的特性,无法采用自然的办法大量饲养蜘蛛。

2)蜘蛛丝的生物结构

蜘蛛丝是如何形成的呢?我们观察到雌性蜘蛛有7个腺体,其中1个腺体生命线,在体内产生能流动的液体,离开蜘蛛体的时候变成固体丝状。液体环境的pH值是7.2,50%蛋白质,NaCl浓度高;经过纺丝器后,变成丝状,体外环境的pH值是5.5,近100%丝蛋白,NaCl浓度非常低。

人工仿制蜘蛛丝,首先需要获得丝蛋白的基因信息,再通过克隆产生大量蜘蛛丝蛋白,经过纺丝器产出蜘蛛丝。其中纺丝器部分最难仿制,涉及机械、材料等学科领域。天然丝蛋白基因不容易完全复制,人工设计丝蛋白要求产量高、水溶性高、稳定性强、丝蛋白质量高,即消耗小、产能高。

在大量生产前,有几个问题需要回答:①丝蛋白的基因序列是什么?②蛋白质的水溶性非常低,丝蛋白如何以50%的高浓度液体状态存在,而性质不变?③丝蛋白水溶液在什么条件下形成固体材料,且保持了较好的强度和导热性能?④丝蛋白的结构与功能之间的关系是怎样的?

(1)金圆网蛛丝蛋白基因序列的鉴定。

经过抓蜘蛛、解剖蜘蛛、拿出腺体、提取RNA、建cDNA库、比对蜘蛛丝的基因序列等一系列步骤,我们确定了TuSpl、TuSp2、AcSpl、MiSpl、MaSp1这5个蜘蛛丝基因。有了基因序列,可以确定蛋白的基本结构。丝蛋白是由信号肽、N端、C端和中间多个重复单元组成的,相对分子质量约为300000。信号肽指导丝蛋白分泌到细胞外,在胞外信号肽就被剪切掉了。氨基酸序列也称一级结构,一级结构无法对功能做出解析。因此,在2006年和2007年,我们发展了一套自己的利用核磁共振解析蛋白结构的方法,利用这个方法解出了丝蛋白单个结构域的二级结构,即氨基酸在空间的排列。

(2)丝蛋白的二级、三级结构解析,分析丝蛋白的高水溶性。

我们通过核磁共振方法解析几个单结构域的二级结构,N端、C端和中间重复单元的二级结构都是α螺旋,连接单元是无序结构。

二级结构中的红色代表负电荷基团,黄色代表疏水性基团,白色代表亲水基团,蓝色代表正电荷基团。如何判断一个蛋白质是疏水还是亲水,就看有多少黄色的基团在蛋白质外面,黄色的基团越多,疏水基团暴露得越多,水溶性就越差;如果表面都是红色的带负电荷的基团,也是互相排斥、不太聚集,水溶性就较好。

MiSp-C端:两个单体聚合成一个双体,水溶性非常好,溶解度约为300 mg/mL;AcSp-C端:表面正负电荷都分布,会互相聚集,水溶性差,溶解度约为30 mg/mL。(www.xing528.com)

AcSp-N端:表面电荷分布有正有负,容易聚集,水溶性低,溶解度约为15 mg/mL;MaSp-N端:表面主要为负电荷,水溶性高。

中间的重复单元MiSp-RP:表面黄色疏水性基团多,溶解度约为5 mg/mL。

连接单元MiSpl-LK:无序结构,水溶性差,溶解度约为1 mg/mL。

我们将单个结构域拼在一起,合成了两个人工蜘蛛丝蛋白,NTD-(LK-RPLK)3-CTD和RP-LK-CTD。NTD-(LK-RP-LK)3-CTD连接了3个重复单元,而天然的蜘蛛丝蛋白的重复单元有10~20个。我们发现,NTD-(LK-RPLK)3-CTD的水溶性大于200 mg/mL,RP-LK-CTD的水溶性约为150 mg/mL,比单个结构域水溶性的简单相加和平均要高得多。

我们研究RP-LK-CTD的结构模型,发现在低浓度下,RP-LK-CTD的C端连接形成双体;高浓度下,更多的聚集形成胶束结构,疏水基团在里面,亲水基团在外面,形成一个球体,类似于洗衣粉的结构,有很强的水溶性。

(3)哪个结构域对成丝有贡献,是不是单个结构域就能成丝?

我们通过组合不同的单结构域,发现单个结构域不能成丝,没有重复单元的结构域组合不能成丝,有重复单元的两个或三个单结构域组合都能成丝。

通过电镜显微成像发现,丝蛋白在成丝初期形成几百纳米的小圆球,小圆球再聚集形成微米量级的圆球,再聚集成丝,单根丝再聚集形成多根丝,如同多根小绳子拧在一起形成一根结实的绳子。

目前我们对蜘蛛丝的原子排布、聚集过程、强度为什么这么好等还不是很了解。但通过这次研究我们知道,N端、C端、重复单元、连接单元对蛛丝的形成都是必需的,其中水溶性差的连接单元对自动聚集成丝可能有非常重要的作用。

3)人工仿制蜘蛛丝蛋白

经过以上的研究,我们就想人工设计产量高的丝蛋白基因,将基因克隆到大肠杆菌,形成量产。我们设计了两种丝蛋白。

(1)10RP1RP2CTDMi丝蛋白。

我们将两种不同的丝蛋白基因混合,10RP1RP2CTDMi,连接10个重复单元,相对分子质量是185000,而天然丝蛋白的相对分子质量为300000~400000,为了更接近自然状态,在C端引入化学键巯基,在一定条件下巯基之间形成二硫键,可以减少丝的断头数目,增加强度,形成13.72μm的人造丝。而天然蛛丝是用非化学键连接的,是以如范德瓦耳斯力、正负电荷等弱相互作用连接起来的。与天然蛛丝相比,11RPC在300 MPa的压力下,延伸到10%时断掉,天然蛛丝在100 MPa的压力下,延伸到60%时断掉,说明人工丝蛋白的强度比天然蛛丝好,但延伸性和韧性差。造成功能差异最主要的原因可能是纺丝器的差别,人工丝蛋白是用注射器推出来的,而天然蛛丝的纺丝器原理尚不明确。

(2)NTD-LK-RP-LK-CTD丝蛋白。

我们人工组装了一个包括C端、N端、重复单元和连接部分的丝蛋白基因,并引入一个剪切力,用泵推注射器,注射器的针头连接一个直径为128μm的细管道,且管道出口上的环境pH值是7,管道出口外的环境pH值是5。通过这个装置,可以推出连续不断、长达几米的丝,但性质还是没法跟天然蛛丝的相比。

我们进一步的工作方向是改进人造丝的生产工艺,让单根丝蛋白更粗一些,少产生断头,并改进纺丝器,使其更接近自然生物体的状态。另一方面,我们想知道成丝后的结构是什么样的,它的结构与性质又有什么关系。我们已经研究了丝蛋白成丝之前的二级结构主要是α螺旋,成丝之后的二级结构就由α螺旋变成β折叠和随机结构等,具体的原子分布还是未知的。再者,成丝的机制是什么?已知引起结构变化的因素有环境pH值、剪切力、蛋白质结构以及1%无序结构。推测成丝时,pH值的变化和剪切力使α螺旋变成无序结构,再形成β折叠。那如何在实验过程中引入剪切力呢?这就需要很多不同的技术来共同攻克这些难题。

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