从刘邦清理异姓王的事情可见，他清理的都是手握军权的大将，对于文臣他则没有那么狠毒，而是通过防微杜渐的办法来打击功臣，让他们老老实实地做好本职工作。打击萧何就是一个典型。
萧何，刘邦的心腹，曾为刘邦立下汗马功劳。自起事起，萧何就坚决支持刘邦，后来刘邦的事越做越大，兵强马壮，横扫天下，萧何为他筹备粮草，管理后方，引荐人才，管理得井井有条。军队进咸阳的时候，别人都抢钱、抢女人，只有他入府库，收集天下图册文书，待刘邦夺得天下之后，很快就弄清全国的人口分布，并因此制定出合适的法律制度。
即便这样的功臣，开国后也遭到了刘邦的打击。
开国后刘邦经常出征，对萧何有些不放心，但是他对于这大后方有些鞭长莫及，便多次派使者回到关中慰劳萧何。分析起来，这“慰劳”是有深意的，一是探看萧何在干什么，有无造反意图和举措，二是示恩于萧何，笼络萧何之心。萧何当时并没有想得很多，但有一个叫鲍生的幕僚看出了刘邦的真正意图，对萧何进言道：“汉王在中原风餐露宿，亲冒矢石，却反倒多次来慰劳您，是对您据守关中不放心啊！我看您不如将兄弟和子孙中能拿兵器的人都送到汉王那里参军，汉王才会放心。”
鲍生的意思是，萧何要将自己亲属中能打仗的都送往刘邦前线，既表示萧何不想用这些亲属做得力臂膀割据关中，又表示了萧何对刘邦的全力支持，使刘邦不再疑忌萧何。
萧何听了鲍生的话，翻然猛醒，立即照办，这才使刘邦对萧何放心了。
这是萧何第一次释去刘邦之疑，办法是送自己的亲属去前线充军。
第二次是在汉高帝十一年（公元前196年），因陈希造反，汉高祖亲自率兵讨伐，身在邯郸。又一次离开关中，留守关中的大权实际上又落到了萧何手中。
陈希造反后，韩信企图乘高祖离京时做陈希内应，活捉吕后及太子，再配合陈希对汉高祖刘邦前后夹击。吕后接到举报后，和萧何密计，杀死了韩信。然后吕后到洛阳迎接刘邦，刘邦听说韩信被杀后，又惊又喜，同时派人拜丞相萧何为相国，并为萧何增加食邑五千户，派一个都尉率五百士兵为萧何看家护院。
在长安的朝官和好友听说萧何升做了相国，且增加了食邑，都来祝贺，唯有一个人前来唱反调，那就是秦故吏召平。(www.xing528.com)
在众人都热热闹闹地向萧何祝贺唱颂歌时，召平却说：“你的祸从今日开始了。”
萧何不明白。召平解释说：“皇上现在亲自率兵远征，您却安守关中，既无征战之功，又无亲冒矢石之劳，却增封土地，亲自派人为公安排宿卫，还不是因为淮阴侯韩信刚刚造反被诛，皇上已经疑心您了吗？亲自为您布置宿卫，怕不是真正关心您的安全吧？”
接着召平又献计道，“您应推辞封赏的五千户食邑，并将自己的家财全部用以资助军需，那样皇上才会高兴。”
萧何按召平之计行事，刘邦才高兴且放心了，二释刘邦之疑。
汉高帝十二年（公元前195年）秋，淮南王英布因韩信、彭越先后被杀，兔死狐悲，也举兵造反。汉高祖起初想派太子带兵平叛，因此前高祖曾想过废太子，但被吕后从商山请来四个很有名的老人相助（即“商山四皓”），因此高祖未能如愿。此次“四皓”老臣怕太子在这次战争中万一打败仗被刘邦借故废掉，设计再次让刘邦亲自率兵出关征讨。在刘邦于中原与英布作战过程中，萧何再次留守关中。因为皇帝不在都城，萧何自觉地履行相国职责，团结勉励百姓，努力生产，并尽可能地将家财和收聚的财赋输往前线支援平叛战争。
这时刘邦又多心了，几次派人来探问萧何在干什么。这时有人又来对萧何提出警告：“您快要被灭族了。试想，您位尊为相国，您的官位还能再提高吗？……您这样努力工作表现好，您认为是在尽职尽责，然而您位极人臣，又在亲附百姓，皇上不会疑心您有更大的欲望和企图吗？”
有人更直白地对萧何说：“何况您最先进入关中，本来就深得百姓拥护，您现在继续取得百姓好感，皇上必然疑心您要占据关中，动摇汉家根基。我看您不如胡作非为一次，使百姓对您反感，这才能释去皇上的疑惧。”
萧何听从了这位智士的话，以相国的权势贱价强买百姓的田地，并依势向富有者低息借钱，把自己塑造成一个贪婪相国的形象。于是一些人抱怨起萧何来，刘邦派来的使者将这些情况回报刘邦，刘邦反而高兴起来。
等到刘邦凯旋归来，很多人挡道上书，控告萧何强行以贱价收买民间田宅。
刘邦心中很明白，见到萧何便笑着表示：“做相国的，必须多为百姓做点事啊！现在你为他们争取点福利吧！”
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