其实，有关马来西亚历史最深入的研究大多以专题史体裁出现，主要包括政治史、经济史、马来人史、华人史、印度人史、妇女史、伊斯兰教史、文学史、史学史等，这些专题史研究比通史要深入得多，但本书限于篇幅，只能举其要者加以介绍。
政治史方面，1961年新加坡马来人同盟领袖穆罕穆德出版了《马来人政治运动史》[59]，该书对在马来亚民族独立过程中起过重要作用的马来政治领袖和政治组织进行考察。该书是当时人写当事人，第一手资料丰富。马来西亚华人学者也出版了多部政治史著作。英文著作有谢文庆（Cheah Boon Kheng）的《红星照耀马来亚：日本占领时的抵抗与后续社会冲突（1941—1946）》[60]，该书考察了日据时期前后，马来人和华人的冲突和矛盾。该书资料丰富，分析深入，是类似研究中的代表作。
经济史方面，橡胶业和锡矿业是马来亚的两大经济支柱，也受到学者的关注，这方面的代表作有J. Drabble的《1876—1922年马来亚的橡胶：行业起源》，详细探讨了橡胶业在马来亚的出现和早期发展史。[61]黄麟根（Wong Lin Ken）的《1914年以前马来亚的锡矿业》，对这一时期马来亚锡矿业的发展、生产手段、华人在其中的作用等问题，进行了深入探讨。[62]
对马来人历史的研究当推里奥纳德 · 安达娅的最新力作《同树之叶：马六甲海峡的贸易与种族》（下称《同树之叶》）[63]，以族群网络为线索，对分布在马六甲海峡两岸的马来人族群的主要分支进行梳理。《美国历史评论》杂志的书评认为，《同树之叶》是安达娅学术生涯的巅峰之作，安达娅成功证明了族群在解读东南亚历史中的关键地位。[64](www.xing528.com)
华人史是马来西亚历史的重要组成部分，一向受到新马本土学者、西方学者和中国学者的关注，这方面的研究十分丰富。代表作有林水檺、何启良、何国忠、赖观福合编的三卷本《马来西亚华人史新编》[65]，谢诗坚的《马来西亚华人政治思潮演变》，[66]维克托 · 布赛尔（Victor Purcell）的《马来亚华人》[67]，颜清湟的《新马华人社会史（1800—1911）》[68]等。
印度族群历史的研究相对较少。桑德胡（Kennial Singh Sandhu）的《马来亚的印度人》是这方面的代表作，该书主要探讨印度人移民马来亚的原因、人口增长和构成、经济参与和社会生活，资料丰富，分析深入。[69]泰特（M. D. Tate）的《马来西亚的印度人：历史、问题和未来》是一本较新的专著，比较全面地探讨了马来西亚印度人的历史发展，社会变革及主要面临的问题。[70]
妇女史一直是马来西亚历史研究的薄弱环节，这一状况至今没有改变，迄今只有不多的几部妇女研究著作。主要有Virginia H. Dancz的《马来西亚妇女与政党政治》[71]，华人学者许仁强和邱吉寿的《槟榔屿保良局：一个华族妇女、妓女与福利组织》[72]，范若兰的《移民、性别与华人社会：马来亚华人妇女研究（1929—1941） 》[73]等。
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