借重组之际，凯撒率军撤回到塞萨利行省，粮食刚刚收割，部下马上填饱了肚子。庞培率兵尾随他们，并且和往常一样竭力切断敌军的供给线，同时避免交战。这种战略或许最终会取得胜利——或者庞培本可以掉头向意大利进发，因为当时他夹在凯撒与国家之间——但是，跟随他的很多贵族派元老院议员要求他立刻开战，打败凯撒，结束这场战争。
于是，公元前48年8月9日的早上，庞培在距法萨罗镇不远一条河附近的平原上列队。双方都知道这是决定共和国命运的最后一战。凯撒给部下的口令是“胜利之神维纳斯”，而庞培部下振奋人心的口号是“无敌大力神”。
战争打响了。庞培的骑兵包围了凯撒军团的侧翼。庞培的骑兵虽然多于凯撒的骑兵，但是缺乏战斗经验。而凯撒专门为这次战斗准备了一个步兵团，见时机成熟，命令他们前进。这些步兵冲向战场，将手中的短矛直刺庞培的骑兵，打得他们纷纷向后逃窜。(www.xing528.com)
接着是步兵主力的交战。凯撒训练有素的步兵先是步行前进，而后是疾奔，在相距15米(50英尺)处，投出致命的短矛。庞培的部下予以还击，但那令人害怕的、纷至沓来的短矛最终还是造成了重大伤亡：第一道防线的士兵倒地呻吟，身上的短矛颤动不已。驻守第二道防线士兵继续猛烈奋战，直到凯撒投入的兵力越来越多，敌军被迫后撤并最终开始逃窜。凯撒的军队兴高采烈，乘胜追击。
此时凯撒下令，允许庞培的部下投降。马库斯·朱尼厄斯·布鲁士斯就是弃剑投降者之一——他是凯撒情妇塞尔维利亚之子——受到凯撒的热情欢迎。庞培甩掉深红色的将军斗篷，与几个保镖立即朝岸边驶去，起航逃往埃及。与他一起逃亡的还有其家人。在法萨罗，他精疲力竭，几乎丧失了一切斗志。庞培逃亡时，凯撒庆祝了这次大捷，俘获24000人，杀敌15000人；相比之下，自己的部下可能只损失200人。
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