分工协作原则作为组织设计中遵循的传统原则之一，是指政府组织内部既要分工明确，又要互相沟通、协调合作，以达成共同的目标。其中，“分工” 强调依据提高行政管理的专业化程度和工作效率的要求，将政府组织的任务、目标、职责等分成各个层次，明确各个层次、各个部门甚至各个人所应完成的工作；“协作”则强调政府组织之间以及组织内部各部门之间的协调与配合，是构建于合作基础之上的一种协调关系。“精良的工具能促使行政活动过程短而效率高，反之，就会拖延时机，产生不良后果。”[13]在此处，“精良的工具” 实则包含了政府组织机构设置和分工协作之优良状态的含义。因此，分工协作原则与上述的精简高效原则之间实则是一种正向促进的关系，政府组织机构之间分工协作水平高，行政管理的效率也自然会提升。
政府组织之间以及政府组织内部各机构之间的分工协作效果如何，决定了政府组织的法治化程度和权力配置的实现效果。每一个机构都是由各部门或者各个隶属的层级组成的，在不同的职能目标理念下，部门之间的组合方式各异。譬如，尖型结构有利于强化政府组织的行政权力，加强行政控制。反之，扁平化结构则有利于发挥下级政府组织的创造性和积极性，促进组织的民主性和灵活性。因此，在推进法治政府建设的进程中，政府组织的机构设置成为改革的重中之重，它直接影响了政府组织机构之间的分工协作机制的畅通性和高效性。在迄今为止最新的一轮政府组织机构改革中，尤其重视机构设置中的分工协作状况。比如，在中央层面的机构改革中，组建农业农村部作为国务院组成部门，并将中央农村工作领导小组办公室的职责、农业部的职责，以及国家发展和改革委员会的农业投资项目、财政部的农业综合开发项目、国土资源部的农田整治项目、水利部的农田水利建设项目等管理职责整合并入其中，主要负责“三农”工作的战略统筹、管理和监督。在层面的机构改革中，各省、自治区、直辖市配合中央加强党政机构设置和职能配置的协同性，纷纷将原监察厅的职责与省级人民检察院查处贪污贿赂、失职渎职及预防职务犯罪等反腐败相关职责整合，组建省级监察委员会，同省级纪律检查委员会合署办公，履行纪检、监察两项职责，实行一套工作机构、两个机关名称。在不同的地方政府组织机构之间，也通过职能整合实现分工协作，如湖北省将省政府金融领导小组办公室的职责，以及省经济和信息化委员会的融资性担保行业监督管理职责，省商务厅的典当行、融资租赁公司监督管理职责，省工商行政管理局的小额贷款公司监督管理职责进行整合，组建省级地方金融监督管理局，作为省政府直属机构，对外加挂省金融领导小组办公室牌子，等等。(www.xing528.com)
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