创新农业经营体制机制，使生产关系更好适应生产力发展，是新时期我国农业农村发展的必然要求。[30]
改革开放以后，我国在农村实行了以家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制。虽然不少人对家庭经营的合理性产生怀疑，[31]但农业实行家庭经营，是由农业本身的特性决定的；即使在已经实现了农业现代化的国家，无一例外仍在实行家庭经营。[32]有鉴于此，创新农业经营体制机制，不能动摇家庭承包经营这一基础。以家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制，是我国农村改革所取得的最重要的制度性成果，而且已经载入了我国宪法。
与此同时，也必须承认，家庭经营，尤其是发展中国家的家庭经营，普遍存在经营规模小、生产效率低、现代化程度不高等诸多弊端。[33]在我国，为了克服此类弊端，遂实行以家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制，亦即有“分”有“统”，“统分结合”，以期充分发挥分散经营与统一经营两方面优势。遗憾的是，实践中，大多数集体经济组织“统”得不够，为农户服务的功能有限，统分结合的双层经营体制流于形式，使农民在市场化和全球化进程中处于不利地位。[34]为此，中央适时提出，应构建新型农业经营体系。构建新型农业经营体系，应以发展农民合作组织为重点。[35]农民合作组织的典型代表即农民合作社。农民合作社与集体经济组织不同，用农民的话说，叫作“生产在家，服务在社”。这个“两在”，生动、形象地说明了农民合作社与家庭承包经营的关系：生产上的问题，由家庭负责；产前、产中、产后服务由农民合作社提供。这样，既坚持了家庭承包经营这一农村基本经营制度，又有效解决了统分结合的双层经营体制中“统”的功能不足的问题。[36](www.xing528.com)
农民合作社通过农户间的联合与合作，提高了农民的组织化程度，正在成为推进我国农业经营体制机制创新的重要载体。[37]
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