首页 理论教育 PubMed常规检索-系统化学习方法

PubMed常规检索-系统化学习方法

时间:2023-08-12 理论教育 版权反馈
【摘要】:打开PubMed主页面,可以看到界面简单清晰,它有使用帮助、PubMed工具、最新文章推荐、近期热门文章、特色评论、其他资源这几个板块,在最上方则是检索框。图4-19PubMed主界面PubMed的布尔逻辑运算符,AND、OR、NOT分别表示逻辑“与”、逻辑“或”逻辑“非”,运算规则是按检索式从左到右顺序运算,圆括号内的可优先运算,并支持截词检索,截词符“*”表示0~N个字符。第四种方法,通过主题词进行检索,主题词检索是PubMed特色的检索方法。

PubMed常规检索-系统化学习方法

打开PubMed主页面(图4-19),可以看到界面简单清晰,它有使用帮助、PubMed工具、最新文章推荐、近期热门文章、特色评论、其他资源这几个板块,在最上方则是检索框。

图4-19 PubMed主界面

PubMed的布尔逻辑运算符,AND、OR、NOT分别表示逻辑“与”、逻辑“或”逻辑“非”,运算规则是按检索式从左到右顺序运算,圆括号内的可优先运算,并支持截词检索,截词符“*”表示0~N个字符。检索方法有基本检索、高级检索、主题词检索、单篇引文查询、临床查询等。

例4-10 检索有关肾脏肿瘤文献

第一种方法,用基本检索的自动词语匹配检索功能。自动词语匹配(Automatic Term Mapping)是PubMed的特色检索技术,当输入任何一个未加任何限定的检索词时,系统会将其按照Mesh转换、期刊转换、短语转换表、作者索引的顺序进行核对、转换、匹配和检索。

直接在检索框输入renal cancer,一共检索出11万多条记录,在Search details中看到,系统自动将我们输入的renal cancer转换成了kidney neoplasms进行主题词检索,以及将renal cancer拆分成renal或kidney(肾脏)、cancer或neoplasms(癌症)再用逻辑算符“AND”来进行检索。对检索结果分析后发现,自动词语匹配检索功能检索出的文献虽多,但查准率并不高。

第二种方法,我们用基本检索中的短语检索。即将短语加上双引号进行精确检索,且当精确检索时,PubMed会关闭自动词语匹配功能。还是检索肾肿瘤,在检索框中输入双引号“renal cancer”,结果显示共找到5千多条记录。这比前一种自由词匹配检索的结果要少很多。我们再来看Search details显示,系统将“renal cancer”作为一个不能拆分的词组进行全字段检索,这样检索的好处是renal cancer作为一个整体概念不能拆分检索。但是全字段检索针对性不强,而且也会将kidney neoplasms作为病名的文献漏检。

第三种方法,利用基本检索中的字段检索。字段检索是在检索框中输入检索词,并在后面加上想要限定的字段,且字段必须用中括号括起。常用的字段检索有著者[AU]、地址[AD]、期刊[TA]、篇名[TI]、语种[LA]等。比如我们想要检索标题中含有肾肿瘤的文献,就在检索框中输入renal cancer[TI],点击Search即可。

第四种方法,通过主题词进行检索,主题词检索是PubMed特色的检索方法。操作方法是选择主题词MeSH,或者More Resources下的MeSH Database输入检索词renal cancer进行检索。(www.xing528.com)

浏览相关的主题词,选择最相关的那个点击。在这里我们选择与肾肿瘤相关的主题词Kidney Neoplasms,点击进入主题词检索界面。

在Kidney Neoplasms主题词检索界面,可以看到有主题词定义、副主题词选择表、树状结构图(图4-20)等内容。副主题词是对某一主题词的概念进行限定或复分,PubMed共有83个副主题词,每个主题词都有固定的副主题可以选择。根据需要可选择有关的副主题词,如果不选则默认全部副主题词。在本次检索中如果想要检索有关“肾肿瘤”治疗方面的文献,应勾选diet therapy、drug therapy、radiotherayp、surgery、therapy这几个有治疗相关的副主题词。

在副主题词下方还有两个选项,点选“Rrestrict to MeSH Major Topic”表示将检索词限定在主要概念主题词(Major Topice)进行检索,这样会缩小检索范围,但检出的文献与检索词的相关度会更高,可以根据检索需要进行勾选。点选另一项“Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy”则表示不扩展检索该主题词的下位词。在可以树状结构中看到,位于下一级的主题词就是下位词,一般是默认扩展下位词检索的,但如果勾选了这个选项就表示不扩展检索,这样容易漏检,所以一般不勾选该项。完成勾选后点击右边的“Add to search builder”构建检索式,最后点击“Search PubMed”完成检索。

图4-20 主题词的树状结构

结果显示通过主题词检索肾肿瘤治疗方面的文献,共找到29000多篇,还可以通过左边的过滤器“Filters”对文献进行更精确的限定,比如常用的限定有Article types(文献类型),可选择Clinical Trial(临床试验)、Review(综述)等文献类型;Text availability(文本可获得性),可选择文献带有Abstracts(文摘)、Full text(全文链接)或Free full text(免费全文链接);PubMed Commons(PubMed空间 ),可选择是否显示读者在PubMed空间对文献的评论(Reader comments);Publication dates(出版日期),可选择或输入相应的年份;Species(物种),可限定研究对象是Humans(人类)或是Other Animals(其他动物)。其他还可从Ages(年龄)、Languages(语种)、Sex(性别)等方面进行限定。有些过滤是隐藏起来的需点击Show additional filters才能进行勾选显示。

如想对刚才检索结果限定为近五年出版的、文献类型是临床试验类型的文献,就可以点选左边Article types下的Clinical Trial,以及Publication dates下的5years(图4-21)。这样进行两次过滤后文献数进一步缩减到386篇。需注意的是一旦勾选了过滤器选项,那么过滤会一直保留,如果不想继续过滤必须要选择“Clear All”去除过滤。主题词检索优点很明显,主题词对同一概念不同表达的方式进行规范,且可以使用副主题词进行限定,使结果更专指准确。但缺点是主题词的标引需要时间,对于新收录的但未进行深度标引的PreMedline中的文献可能会存在漏检。

图4-21 检索结果页面

免责声明:以上内容源自网络,版权归原作者所有,如有侵犯您的原创版权请告知,我们将尽快删除相关内容。

我要反馈