1998年1月—2008年1月，自治区人民政府直属全额拨款或差额补贴的事业单位13个：广西农业科学院、自治区供销合作联社、自治区二轻城镇集体工业联社、自治区地质矿产勘查开发局、广西科学院、广西社会科学院、广西出版总社、自治区通志馆（自治区地方志编纂委员会办公室）、自治区机械设备成套局、自治区招商促进局、自治区人民政府发展研究中心、广西国际博览事务局、自治区水库移民工作管理局。
广西农业科学院（正厅级） 1957年6月成立时称为广西省农业科学研究所，前身为1935年在柳州沙塘创办的广西农事试验场。1964年改为广西壮族自治区农业科学院。1981年6月定为正厅级，为自治区人民政府直属全额拨款事业单位，是广西综合性的农业科学研究机构。
主要负责人任职情况
自治区供销合作联社（正厅级） 1954年8月在广西省人民政府合作事业管理局的基础上成立广西省供销合作社，作为政府工作部门。1958 —1984年，广西供销合作社曾与广西国营商业3次合并，3次分立。1983年全自治区供销合作社体制改革，自治区供销合作社退出政府工作部门序列，改为集体经济组织，参照事业单位管理，使用事业编制（财政全额拨款），为自治区人民政府领导的全自治区供销合作社的联合组织（正厅级）。
主要负责人任职情况
自治区二轻城镇集体工业联社（副厅级）1954年8月成立时称广西省手工业管理局。1956年1月成立广西手工业集体联社，在广西省手工业管理局增挂牌子。1957年、1969年广西手工业管理局2次撤销，1961年12月、1973年8月2次恢复。1975年4月并入自治区轻工业局，1985年9月恢复设立自治区第二轻工业局（副厅级）。1995年3月撤销自治区第二轻工业局，组建自治区二轻工业总公司，保留广西区二轻城镇集体工业联社的牌子，核定事业编制，为自治区人民政府直属的二轻城镇集体工业的联合组织（副厅级）。
主要负责人任职情况
自治区地质矿产勘查开发局（正厅级）1956年2月成立时称地质部广西省地质局。1958年3月改为自治区地质局，列为自治区人民政府直属机构。1964年1月改为地质部广西地质局。1971年5月设立自治区革委会地质局。1980年1月更名为自治区地质局。1983年5月更名为自治区地质矿产局，上划地质矿产部管理。1995年3月机构改革过渡期，实行自治区地质矿产厅、地矿部广西地质矿产勘查开发局“两块牌子、一套人马”，其中自治区地质矿产厅由垂直管理机构改革为自治区人民政府工作机构，地矿部广西地质矿产勘查开发局仍由原地矿部垂直管理。1999年，全国地勘队伍启动实行属地化管理政策，自治区地质矿产厅与自治区土地管理局合并组建自治区国土资源厅，地矿部广西地质矿产勘查开发局则更名为自治区地质矿产勘查开发局，性质为事业单位。2001 年3月，经自治区人民政府同意，由自治区地质矿产勘查开发局统一接收管理驻桂地勘队伍（包括有色地勘单位、核工业地勘单位），重新组建新的自治区地质矿产勘查开发局，性质为自治区人民政府直属正厅级全额拨款事业单位。
主要负责人任职情况
广西科学院（正厅级） 1978年5月开始筹建，1980年1月正式成立。1985年5月核定为相当正厅级全额拨款事业单位，为综合性自然科学研究机构。
主要负责人任职情况
广西社会科学院（正厅级） 1964年成立时称广西哲学社会研究所，1969年撤销，1977年9月恢复。1979年2月更名为广西社会科学院，为自治区人民政府直属的相当正厅级全额拨款事业单位。
主要负责人任职情况
广西出版总社 1986年6月，自治区出版事业管理局不再与文化厅合并，改为自治区出版总社，定为相当厅级事业单位。1987年6月，自治区出版总社增挂“自治区新闻出版局”牌子。1995年9月，自治区新闻出版局、自治区版权局、自治区出版总社实行“一个机构、一套人员、三块牌子”，承担行政管理职能，使用事业编制，实行企业化管理。2002年9月，广西出版总社与自治区新闻出版局（自治区版权局）分离，该社为自治区人民政府直属正厅级事业单位，实行经费自理、企业化管理。
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① 杜森，2019年11月，接受自治区纪委监委纪律审查和监察调查，并被采取留置措施。［来源：广西纪检监察网］
自治区通志馆（自治区地方志编纂委员会办公室）（正厅级） 1932年3月成立时称广西省修志局。1943年1月改称广西省通志局，同年3月改称广西省通志馆。1949年11月广西省通志馆解散。1959年8月重建广西壮族自治区通志馆。“文化大革命”期间，通志馆被撤销。1981年9月通志馆恢复。1986年2月成立自治区地方志编纂委员会，办事机构为自治区通志馆。2006年1月，自治区通志馆撤销，改为自治区地方志编纂委员会办公室，为自治区地方志编纂委员会的常设办事机构，是自治区人民政府直属相当正厅级全额拨款事业单位。
主要负责人任职情况
自治区机械设备成套局（正厅级） 1979年10月，自治区机械设备成套公司改为自治区机械设备成套局，受国家机械设备成套总局和地方双重领导，以国家机械设备成套总局管理为主。2002年5月下放广西管理，为自治区人民政府直属的厅级差额拨款事业单位。
主要负责人任职情况
自治区招商促进局（正厅级） 1984年4月设立时称自治区经济协作办公室，1995年3月改为自治区人民政府直属事业单位。2004年9月原自治区人民政府外商投诉中心、自治区经济技术协作办公室、自治区外商管理办公室，合并组建自治区招商促进局，对外挂自治区人民政府投资投诉中心、自治区经济技术协作办公室两块牌子，为自治区人民政府直属的相当正厅级财政全额拨款事业单位。
主要负责人任职情况
自治区人民政府发展研究中心（正厅级）
1982年10月成立自治区人民政府经济研究中心。2001年4月，自治区人民政府经济研究中心与自治区农村发展研究中心合并，组建自治区人民政府发展研究中心，为自治区人民政府直属相当正厅级全额拨款事业单位。
主要负责人任职情况
广西国际博览事务局（正厅级） 2003年12月成立，为自治区人民政府直属相当正厅级经费自理事业单位，与中国—东盟博览会秘书处“一个机构、两块牌子”。
主要负责人任职情况
自治区水库移民工作管理局 前身是自治区水利厅移民安置办公室和自治区移民开发办公室。2000年7月，自治区编委同意将上述两单位合并，设立自治区库区移民开发局，为自治区人民政府办公厅管理的财政拨款事业单位，规格相当于县（处）级。2005年7月，报自治区党委、自治区人民政府批准，自治区库区移民开发局更名为自治区水库移民工作管理局，升格为相当副厅级事业单位，直属自治区人民政府管理并全额拨款。
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