黄杰的第八军经过整编辖三个师，即一〇二、一〇四、四十等师。四十师系由税警总团编成，由黄自兼师长。1938年徐州会战后，黄军奉命集结于商邱附近地区，隶属第一战区（司令长官程潜）第二兵团（司令官薛岳）战斗序列。5月21日兰封会战揭幕，黄军担任夏邑、永城、砀山一带守备，堵击日军向商邱进犯。当时围攻商邱的日军约一个旅团，另附炮兵一个联队，机械化兵一个营，工兵、通讯、汽车各一个中队。黄率部协同友军对敌人迎头痛击，战况异常激烈。黄在民权附近指挥战斗时，坐骑遭敌流弹击毙，而他本人却安然无恙。由于黄军有力阻击，日军进犯商邱企图未能得逞。敌为分散我军兵力，另部日军突从兰封附近渡河南犯，造成开封吃紧，郑州告急。第二兵团主力增援兰封，只留下第八军守备商邱，实力单薄，孤立无援，但黄仍指挥所部浴血奋战，击溃敌快速部队一次又一次进攻。与此同时，驻夏邑的一个团和驻砀山的一零二师，由于连日来受到优势之敌包围，受创甚重，且无救兵增援，被迫于5、6 两日突围退至商邱，各路日军乘隙跟进，形成商邱县城层层被围的严峻局势。自6日起，商邱县遭到日军猛烈围攻，黄杰拼死奋战5 昼夜，几次突围均未成功，伤亡惨重。10日下午，黄以电话向副司令官汤恩伯汇报战况，并取得汤的同意缩短商邱城以南战线，部队逐渐向柳河靠拢，与十二军孙桐萱部取得联系。至11日拂晓，商邱前线被敌突破四处，陷于东、北、南三面被包围之中，孤军无援，情势危急。黄为避免全军覆没，命令一六八师师长彭林生率该师死守商邱，如3 天后不能坚持，可向开封方向撤退。12日黄率军部及四十师撤至柳河车站附近，命令一〇二师撤至开封附近待命。当日，黄接蒋介石自汉口来电，令黄杰率部撤至平汉路西侧襄城整训。后蒋获悉彭师仅守商邱一天，便因伤亡惨重被迫西撤，以致商邱失守，影响全线动摇。蒋在盛怒之下，电令将黄撤职查办。虽说胜败乃兵家常事，但黄并没有寻找任何借口企图减轻或推卸商邱弃守的责任，奉撤职查办令后，即匆匆束装就道赴汉口受审。同行的只有军参谋长周学海一人。
到达汉口，黄主动去找军法执行总监何成浚报到，何说：“我奉命查办你的案件，在没有查明真相不能确定你是否应负刑事责任以前，你还是暂驻外面听候通知吧！”黄坚决要求收监，何只好命其暂住总监部某书记官办公室。何事后对人说：“像黄杰这样自觉守法的军人，我还是第一次见到。”
关于商邱作战的“战斗译报”，早已由参谋长周学海写好，分报“两部”（军令部和军法执行总监部）“一室”（委员长侍从室），正分头审查中。蒋介石余怒未消。一天汤恩伯从河南前线来见蒋：“报告委座：黄杰守备商邱是归我指挥的，他的作战部署，都经过我批准，所以商邱失守的责任应由我负，要查办请查办我。”听了汤的汇报，蒋介石只“唔”了一声，没有表态。(www.xing528.com)
过了几天，师长彭林生前来谒蒋：“报告校长（黄埔毕业生都称蒋为校长）：黄军长命我坚守商邱三天，我只守了一天，便伤亡惨重败下来，放弃商邱应由我承担责任。”蒋仍然是只“唔”了一声，不置可否。
半月后，“两部”“一室”一致向蒋汇报根据战斗译报和向有关人员调查的证实，黄杰不够查办条件。蒋介石的气消了，他大笔一挥：“黄杰免予议处，将军长职务交卸后，即赴成都黄埔军校就任教育处长。”
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