且说南北统一的结果，国父辞去临时大总统职务，临时参议院改选袁世凯继任，并请袁氏到南京去就任。袁氏是个狡猾之徒，如何肯离开他的老巢？于是暗中叫部下举行兵变。扬言非由本人坐镇北京，不能维持北方的秩序。无意坚持原有主张的临时参议院，只得“抬起衙门就知县”，允许迁都北京。一个革命的首都只有建立在革命的环境中，有革命的民众与军队巩卫，才能够执行革命的政策，所以国父在那时候坚持必以南京为首都。将首都迁到反动的巢穴里去，这是反革命派的又一胜利。
袁世凯在北京就任临时大总统以后，就努力想组一个适合自己意思的内阁（他把第一任内阁唐绍仪赶走，换了自己亲信的赵秉钧），努力在议会选举中培植自己与党（时步党）的势力。但是从同盟会变化出来的一个大党——国民党，在国会选举中获得大多数的议席，国民党有力分子宋教仁准备以议会多数党的背景出来组阁。这在各立宪国家是很合乎规律的，袁世凯如果是遵守法治原则的，当然只能承认国民党登台执政，自己安心做个法国式的总统，但袁氏拥有庞大武力，又有野心，又绝不在革命势力包围的环境下，他肯让国民党取得胜利吗？(www.xing528.com)
在民国元年国会还没有成立的时候，这个斗争还没有表面化，到民国二年国会开会（4月8日开会）的前后，时局就开始紧张、开始转变。有两件重要事情：一件是大借款，袁世凯不经国会通过，擅自向英、法、德、日、俄五国银行团借款两千五百万镑，叫作善后借款，以办理革命善后事宜为名，其实是扩充武力，准备铲余南方势力，所以上海及南方各省报纸对这件事攻击得很厉害。还有一件是宋教仁被刺。宋案发生于上海的北火车站，是袁世凯让赵秉钧暗派心腹收买流氓干的，该案虽在上海侦查审讯，但是袁氏党羽布置周密，重金贿赂，很难做到水落石出。所以国民党影响下的报纸，揭穿袁氏阴谋，加以攻击。同时国会开会后，对借款与宋案问题，也提出质问。民国二年上半年，国内政治形势异常紧张，袁世凯懂得“先下手为强”，所以“国民党第二次革命”的主张还没有成熟的时候，袁氏就早已布置军事，并拉拢了坐镇武汉的黎副总统元洪，使他守中立，然后一道命令下来，将国民党三都督（江西都督李烈钧、广东都督胡汉民、安徽都督柏文蔚）免职。当国民党军人被迫反抗时，汤乡铭与张动海陆部队即采用主动攻势，迅速剿平讨袁军了。
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