甘肃检验检疫组织机构主要包括内设机构、直属事业单位、直属企业、社团组织四类，随着甘肃检验检疫业务的增长和事业的发展，甘肃检验检疫的组织机构日益完善，职能也更加细化。集宁商检局兰州进出口商品检验处成立后，仅有化验室、轻畜产品检验室、行政办公室、人事科4个内设机构和西宁、西安、银川3个外派工作组。兰州动植检局设综合业务办公室、动物检疫室和植物检疫室3个内部机构，兰州卫检局仅有办公室和业务处2个内部机构。改革开放后，随着甘肃省外经贸事业的不断发展，甘肃检验检疫业务的范围和数量迅速增长。与之相对应，甘肃检验检疫的组织机构设置也发生了显著变化：业务处室设置日益完善，行政管理职能日益细化，监察审计和党政管理等职能日益完善，企、事业单位和社会团体迅速发展，分支检验检疫局综合实力不断提升，口岸检验检疫机构从无到有。截至1998年，甘肃商检局共设办公室、综合处、检验监管一处、检验监管二处、检验监管三处、检务处、人教处、计财处8个处室和机关党委、监察审计室2个工作机构，综合检测中心、西北评审中心甘肃分中心、商检设备西北维修中心、机关服务中心4个直属事业单位和甘肃商检公司1个企业，下属天水、平凉、酒泉3个地区局。兰州动植检局设办公室、综合业务处、动物检疫处、植物检疫处和人事处5个科室和甘肃宏通贸易公司1个企业。兰州卫生检疫局设办公室、卫生监督科、进口食品卫生监督科、检疫查验科4个科室，“甘肃国际旅行保健协会”及附设门诊部，甘肃中健有限责任公司1个企业。1999年“三检合一”后，在对原“三检”内设机构优化合并的基础上，甘肃出入境检验检疫局下设办公室、法制与综合业务处、科技与认证处、卫生与食品检验监督处、动植物检验检疫处、化矿检验处、机电轻纺检验处、检务处、人事处、财务处10个行政处室，机关党委、监察审计室2个工作机构，综合技术中心、甘肃国际旅行卫生保健中心、机关服务中心、认证评审中心、甘肃商检协会5个直属事业单位，甘肃商检公司1个直属企业单位，下辖天水、平凉、酒泉3个分支检验检疫局。此后，甘肃检验检疫内部机构设置趋于稳定，仅对个别处室进行了分设，在兰州中川机场增设办事处。截至2010年，甘肃检验检疫局共设13个内设机构、2个工作机构、4个直属事业单位、1个企业，下辖3个分支检验检疫局、1个办事处。(www.xing528.com)
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