天窗在使用时，会出现有时不能关闭、在打开后不能完全关闭或者起翘后不能完全关闭的情况，这时需要对其进行初始化设定。天窗在初始化过程中没有防夹功能，勿将手伸入开启的天窗中。
1.装有MD2电动机的天窗初始化方法
1）首先用手动方式强制关闭天窗。
2）取下顶灯盖板（天窗开关的面板），断开电动机线束插头（图3-14）或断开蓄电池负极线，等待10s后再接上线束或电源。
图3-14 断开天窗线束插头
3）如图3-15所示，将开关由关闭位置旋向开启位置方向约15°，再迅速旋回到关闭位置，听见电动机有“咯哒”的响声后，按住按钮，此时天窗将自动完成一个循环的运行，一个自动循环完成后则表明天窗初始完成。
图3-15 天窗开关操作方法
4）关闭点火开关5～7s后，天窗设定记忆完成。
2.装有MD4电动机的天窗初始化方法
1）如图3-16所示，在关闭位置按住开关，等待25～30s。天窗开启到最大化。(www.xing528.com)
图3-16 在关闭位置按住开关
2）玻璃会抖动一下，这时松开并再次按住开关，此时天窗将执行下落、开启、关闭这一自动循环，这也说明天窗初始化完成。
如由于误操作，初始化失败，天窗没有动作，请先关闭车钥匙等待10s，重新按照上述步骤再操作一次。
这两种电动机初始化的差异如下：
MD2电动机初始化前需要先断电，初始化后需关闭点火开关等待5～7s，初始化全过程为60s；MD4电动机直接按住开关即可初始化，但等待时间较长，初始化全过程需要70s左右。
大众车型天窗MD2与MD4电动机的区分，以下面的底盘号为界限，之前的车辆使用的是MD2电动机，底盘号之后（含）的车辆使用的是MD4电动机。
速腾A3073380（灰色内饰）A3070251（米色内饰）
迈腾A3048927（灰色内饰）A3049968（米色内饰）
高尔夫A6 A3230545（灰色内饰）A3230755（米色内饰）
新宝来A3061163（灰色内饰）A3061161（米色内饰）
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