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酵母基因组DNA制备实验

时间:2023-11-02 理论教育 版权反馈
【摘要】:划线法在YPD平板上活化酵母菌,28℃培养,2天后长出单菌落。将菌体悬浮于0.5mL 1mol/L山梨醇,0.1mol/L Na2EDTA,pH 7.5的缓冲液中。10000r/min离心 1min,弃上清,菌体重悬于 0.5mL 50mmol/L Tris-HCl,20mmol/L EDTA的缓冲液中。加入0.05mL 10% SDS,混匀,65℃保温30~60min。将沉淀悬浮于100μL TE缓冲液中,加入2μL无DNase的10mg/mL RNase,37℃,保温30min。提取的基因DNA用双蒸水稀释适当倍数后,在紫外分光光度计上测定OD260和OD280,计算DNA纯度和浓度。OD260/OD280值介于1.8~2时,DNA纯度较高。DNA样品贮存于-20℃。

酵母基因组DNA制备实验

操作步骤如下。

(1)划线法在YPD平板上活化酵母菌,28℃培养,2天后长出单菌落。

(2)挑取活化的单菌落接种于5mL YPD培养基中,28℃,180r/min振荡培养8~10h。

(3)移取1.5mL菌液至无菌EP管中,5000r/min离心5min,弃上清。

(4)将菌体悬浮于0.5mL 1mol/L山梨醇,0.1mol/L Na2EDTA,pH 7.5的缓冲液中。

(5)加入0.02mL 10mg/mL消解酶溶液,37℃保温60~120min。

(6)10000r/min离心 1min,弃上清,菌体重悬于 0.5mL 50mmol/L Tris-HCl,20mmol/L EDTA(pH 7.4)的缓冲液中。(www.xing528.com)

(7)加入0.05mL 10% SDS,混匀,65℃保温30~60min。

(8)加入0.2mL 5mol/L乙酸钾溶液,冰浴60min,12000r/min离心10min。

(9)移取上清至新的EP管中,加入1/10体积的3mol/L乙酸钠(pH 5.2)和2倍体积的无水乙醇,混匀,-20℃过夜沉淀,12000r/min离心10min,将沉淀用70%乙醇洗一次,室温干燥。

(10)将沉淀悬浮于100μL TE(pH 7.4)缓冲液中,加入2μL无DNase的10mg/mL RNase,37℃,保温30min。

(11)提取的基因DNA用双蒸水稀释适当倍数后,在紫外分光光度计上测定OD260和OD280,计算DNA纯度和浓度。OD260/OD280值介于1.8~2时,DNA纯度较高。DNA浓度(μg/mL)=OD260值×50μg/mL×稀释倍数。DNA样品贮存于-20℃。

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