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斑点杂交实验方法简介

时间:2023-11-02 理论教育 版权反馈
【摘要】:斑点杂交是指将DNA或RNA样品直接点在硝酸纤维素滤膜上,然后与核酸探针分子杂交,以显示样品中是否存在特异的DNA或RNA。按上述Southern杂交或Northern杂交所述的方法与放射性标记探针杂交。在杂交过程中,整个滤膜应一直是湿润的,不得干涸。

斑点杂交实验方法简介

斑点杂交是指将DNA或RNA样品直接点在硝酸纤维素滤膜上,然后与核酸探针分子杂交,以显示样品中是否存在特异的DNA或RNA。同一种样品经不同倍数的稀释,还可以得到半定量的结果。所以它是一种简便、快速、经济的分析DNA或RNA的方法,在基因分析和基因诊断中经常用到,是研究基因表达的有力工具。但由于目的序列未与非目的序列分离,不能了解目的序列的长度。尤其当本底干扰较高时,难以区分目的序列信号和干扰信号。

1.实验材料

待分析的DNA或RNA样品,已标记的探针,硝酸纤维素滤膜,滤纸。

2.实验设备

狭槽点样器,真空泵,恒温水浴,真空烤箱等。

3.实验试剂

100%甲酰胺,37%甲醛,20×SSC,0.1mol/L NaOH等。

4.操作步骤(www.xing528.com)

(1)10μL样品与20μL 100%甲酰胺、7μL 37%甲醛、2μL 20×SSC混合,置于68℃,15min后置冰浴中。

(2)用0.1mol/L NaOH清洗点样器,再用无菌水充分冲洗。将一张经20×SSC浸润的滤纸铺在点样器上,上面再铺上一张经20×SSC浸润1h的硝酸纤维素滤膜,加盖并夹紧,接通真空泵。

(3)用10×SSC清洗各样孔。在每一样品中加两倍体积的2×SSC,混合后加样于孔中。外围几个孔中加2μL染料定位,缓慢抽吸。每孔用1mL 10×SSC清洗两次,继续抽吸5min,吸干滤膜。

(4)取出滤膜,夹在两张滤纸中间,80℃真空烘干2h。按上述Southern杂交或Northern杂交所述的方法与放射性标记探针杂交。

5.注意事项

(1)在放射自显影时应注意滤膜必须干燥,并覆盖上保鲜膜,否则,滤膜将与X光片粘在一起,使以后的操作困难。

(2)在杂交过程中,整个滤膜应一直是湿润的,不得干涸。

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