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环状RNA的发现及其在肿瘤中的广泛存在

时间:2023-11-21 理论教育 版权反馈
【摘要】:在同一真核生物体内不同组织中也广泛存在,目前已经明确环状RNA在人睾丸、肾、脑、肝、胃和肺中存在,并且具有高度保守性。此外,研究发现环状RNA广泛存在于生物体内,在RNA家族中占有相当大的比例。Zheng等分析6个正常组织和7个癌组织发现67358个潜在的环状RNA,其中至少27000个含有特殊的反向剪接序列。

环状RNA的发现及其在肿瘤中的广泛存在

随着RNA测序和相关技术的不断成熟,越来越多研究证实环状RNA并非RNA转录剪接的意外产物,而是源自基因的外显子或内含子,在人类、小鼠、果蝇及线虫等各类生物细胞中均大量稳定表达。在同一真核生物体内不同组织中也广泛存在,目前已经明确环状RNA在人睾丸、肾、脑、肝、胃和肺中存在,并且具有高度保守性。不同于线性RNA标准的剪接模式,环状RNA有其特殊的形成机制,通过独特的反向可变剪接方式形成环状,其形成机制可能与基因反向互补重复序列Alu、外显子跳跃剪接、RNA结合蛋白等有关。

随后发现环状RNA在基因调控中发挥重要作用,如作为miRNA海绵吸附miRNA、调控相关基因表达、表达多肽等。这些功能使环状RNA在肿瘤中的作用受到广泛关注,越来越多的学者致力于环状RNA的研究,不断深入探讨其在肿瘤发生发展中的作用机制,力求在肿瘤的诊断和治疗中寻找新的突破。目前已有报道,许多环状RNA在结肠癌胃癌食管癌等多种肿瘤中表达异常,对肿瘤的增殖、侵袭和迁移发挥重要作用。(www.xing528.com)

此外,研究发现环状RNA广泛存在于生物体内,在RNA家族中占有相当大的比例。Jeck等通过高通量RNA-seq在人类成纤维细胞中检测到大于25000多种的环状RNA。Memczak等通过RNA-seq数据结合人白细胞数据库鉴定出约2000种人类环状RNA、1900多种小鼠环状RNA和700多种线虫环状RNA。Rybak-Wolf等分析了哺乳动物脑组织中的环状RNA表达,发现大脑组织中存在大量环状RNA,其在小鼠和人中均保守存在,个别甚至在果蝇中也存在,伴随大脑发育,环状RNA的表达也增高,哺乳动物大脑组织的环状RNA具有高度保守性。Memczak等在两个志愿者外周血中分别鉴定到了4550和4150种环状RNA,并发现血液中环状RNA与线性RNA的比值较高,提示在血液系统中环状RNA可能存在一些未知的功能。Zheng等分析6个正常组织和7个癌组织发现67358个潜在的环状RNA,其中至少27000个含有特殊的反向剪接序列。Dang等在人类着床前胚胎系统分析不含polyA的RNA表达情况,共分析了7个不同胚胎发育阶段的细胞,鉴定出10032个对应于2974个基因外显子区的环状RNA。

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