光绪二十二年（1896年），维新变法运动在四川兴起。时被清廷任命为川省矿务商务监督的宋育仁（曾就读尊经书院），在重庆设立商务局，开办各种实业公司，推动四川民族工商业发展。还联络在渝爱国维新志士，创办了四川第一家近代报刊《渝报》（1897年11月），宣传变法维新，形成了较大声势和影响。1898年初，宋育仁应聘为尊经书院山长，由重庆赴成都，四川维新变法运动的中心也随之转移到成都。宋育仁在成都，以尊经书院为基地，联络具有维新思想的官绅学人潘祖荫、邓榕、吴之英等发起组织了“蜀学会”，还以蜀学会的名义出版了《蜀学报》。《蜀学报》馆设在尊经书院内，由尊经书局印行，宋育仁任总理，吴之英任主笔，廖平任总纂。[30]关于尊经书院、蜀学会、《蜀学报》三者的关系，《蜀学报章程》明确规定：“报局与学会相表里，学会与书院相经纬，分为三事，联为一气。……会内学友论撰，由主会评阅，佳者由报局酬奖登报。书院课卷佳者，由书院送学会参论，交报局发刻，书院已有课奖，报局不另酬奖。学会开讲，报局随即出报。”[31]
“蜀学会”会址设在尊经书院，首次活动于光绪二十四年三月初一（1898年3月22日）在成都三公祠举行[32]。该会章程明载缘起及宗旨：“现在时事棘艰，迭奉上谕，各省振兴学校，以期储材备用。学使慨济时艰，尤以振兴蜀学为念。本年正月又奉明诏，举行经济特科。因此约集同人，联为此会，期以通经致用为主，以扶圣教而济时艰。”其活动“以集讲为主”，借此“变通”之举以“推广学堂”。其内容是“发扬圣道，讲求实学”，“皆以孔子经训为本”，分为伦理、政事、格致三大类：伦理，“以明伦为主”；政事，“首重群经，参合历代制度、各省政俗利弊、外国史学、公法律例、水陆军学、政教农桑各务”；格致，则包括古今中外语言文字、自然科学及各种实用学科，宣称“如有新得之学、新得之理，登报表扬”。入会者皆可“分门讲习”。农历每月朔日（初一）“牌标讲目，学友各将蓄疑新义摘录送会所传阅，列入讲册”；望日（十五日）认题并有论撰者举行集讲；晦日（月末日）“收卷”，集讲者交讲义或论文，并选择登报印行。学会既寓推广学堂之意，乃有教学之功能，要求入会者“每人各具日记一册，每日必有课程。每月册上至少亦须二十日。除会讲外，所有私居著述均归其中。”还发给膏火奖励，会友系书院生由书院发给，非书院生由报馆发给。宋育仁、吴之英、廖平等都先后撰文主讲。[33]“蜀学会”是一个尊崇儒学、振兴蜀学、通经致用的学术研究中心，是宣传维新变法的社会团体，也是尊经书院设在书院外的进行教学活动与联系社会的场所。
《蜀学报》是成都首批出现的近代报刊，是《渝报》的继续。其宗旨是：“此报为蜀中开风气而设。……今于中法成书中专取切于蜀事及近今能行者为主……俟风气渐开，再行添入泰西机器新法。”“蜀中更立此报者，意在昌明蜀学，开通邻省。……本局意主推行，力求实用。”[34]《蜀学报》于1898年5月5日创刊发行后，自7月起每月出三期（共印行13期），发行量达二千多份，在省内外销售发行。其栏目有谕旨、奏折、论文、蜀中近事、中国近事、海外近事等，以论文所占篇幅最多，论文内容不少是宣传维新变法、介绍中外科技的[35]，即所谓“为蜀中开风气”、“昌明蜀学”，为传统儒学乃至社会注入新的内容，对开展维新变法运动和传统蜀学的转型起到推动作用。(www.xing528.com)
1898年9月21日，发生戊戌政变，维新变法运动失败。随后，存在数月的“蜀学会”被禁，《蜀学报》被焚，宋育仁等蜀中维新人士，也遭到政变者的迫害。然而，“蜀学会”和《蜀学报》对四川近代社会和近代蜀学已产生的影响是不小的。
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