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生命科学基础研究入门:非参数检验的重要组成部分

时间:2023-10-30 理论教育 版权反馈
【摘要】:非参数检验是统计分析方法的重要组成部分,它与参数检验共同构成统计推断的基本内容。非参数检验是在总体方差未知或知道甚少的情况下,利用样本数据对总体分布形态等进行推断的方法。由于非参数检验方法在推断过程中不涉及有关总体分布的参数,因而得名为 “非参数”检验。非参数检验方法的优点是适应性强,但由于损失了部分信息,检验效率有所降低。

生命科学基础研究入门:非参数检验的重要组成部分

前面讨论的方法都是以总体分布为正态分布为前提,对参数进行的检验,属于参数检验方法(parametric test),但是实际上,有些资料并不符合上述条件,甚至分布常常是未知的。本部分所讨论的非参数检验方法(nonparametric test),可以不考虑总体的参数和总体的分布类型,而是对总体的分布或分布位置进行检验。非参数检验是统计分析方法的重要组成部分,它与参数检验共同构成统计推断的基本内容。非参数检验是在总体方差未知或知道甚少的情况下,利用样本数据对总体分布形态等进行推断的方法。由于非参数检验方法在推断过程中不涉及有关总体分布的参数,因而得名为 “非参数”检验。

非参数检验通常适用于以下几种情况:

(1)总体分布为偏态或分布未知的计量资料;

(2)等级资料;

(3)个别数据偏大或数据的某一端无确定的数值,如 “<0.01mg”“>150mg”等,只有一个下限或上限,而没有具体数值;

(4)各组离散程度相差悬殊,即各总体方差不齐。

非参数检验方法的优点是适应性强,但由于损失了部分信息,检验效率有所降低。在资料服从正态分布的前提下,当H0不真时,非参数检验方法不如参数检验方法能灵敏地拒绝H0,换句话说,其犯第二类错误的可能性大于参数检验法。因此,对于适合参数检验的资料,最好还是用参数检验。

(一)配对资料的符号秩和检验

配对资料的符号秩和检验(Wilcoxon signed rank test)是配对设计的非参数检验。

1.检验步骤和基本思想

(1)检验步骤

求出各对数据的差值后依次进行下面的步骤:

①建立假设检验,确定检验水准。

H0:差值的总体中位数为零。

H1:差值的总体中位数不为零。

②确定检验统计量T值(包括编秩次并求秩和)。

编秩:依差值绝对值,从小到大编秩,并按差值的正负,标上正负号。编秩时,在正负号不同的差数中,若有绝对值相等的观测值,则取其平均秩次。对差值为0的对子,舍去不计,相应地总的对子数也要减去其对子数,记为n。分别求正负秩次之和T+与T-,并以绝对值较小者作为统计量T值,如公式(3.20)所示:

秩和:正、负秩和相加应等于总秩和,即T++T-=n(n+1)/2,通过对其计算可以判断T+和T-的计算是否有误。

③确定P值,做出统计推断(查表确定P值范围)。

当n≤25时,可查T界值表,T愈小则P愈小。当T恰为表中的界值时,P值一般都小于表中对应的概率值。

应该注意,当n>25时,无法查T界值表,可按近似正态分布用u检验,其公式为:

相同秩次较多时,采用校正公式:

其中ti为相同秩次的个数。得出u值后,按u界值确定P的范围。

式中0.5是连续校正数。因为T值是不连续的,而u分布是连续的,这种校正影响甚微,可以忽略。

(2)基本思想

如果H0成立,即差值的总体中位数为0,则理论上样本的正负秩和应相等,即T值应为总秩和img的一半,即T=img。由于存在抽样误差,T应接近imgT愈小,T与img的差距越大,相应的P值就愈小。当P≤α时,拒绝H0

(二)两样本比较的秩和检验

在t检验一章中,曾介绍了两独立样本均数的比较,但是样本资料要求总体服从正态分布。当此条件不满足时,可采用本节介绍的Wilcoxon Mann-Whitney test方法,其目的是比较两独立样本分别代表的总体分布有无差异。

1.检验步骤与基本思想

(1)检验步骤

①建立假设检验,确定检验水准。

H0:两总体分布相同;(www.xing528.com)

H1:两总体分布不同;

a=0.05。

②确定检验统计量T值(包括编秩次并求秩和)。

编秩:两样本观察值从小到大混合编秩,属不同组的相同观察值取原秩次的平均秩次。

秩和:设n1与n2分别为两样本的含量,规定n1<n2其中为相同秩次的个数。两组合例数N=n1+n2。分别计算两样本含量为n1与n2组对应的秩和T1和T2(两组的秩和合计等于总秩和,即T1+T2=N(N+l)/2,可用于核对),取样本含量小的n1的秩和T1为统计量T值。

③确定P值,做出统计推断。

当n1<10时,查T界值表。T值在表中范围外(包括端点时),P值小于表中对应的概率值,T值在表中范围内,P值大于表中对应的概率值。

当n1与n2超出T界值表的范围时,可按近似正态用u检验:

当相同秩次较多时(如等级资料),采用校正公式:

其中ti为相同轶次的个数。

(2)基本思想

如果H0成立,则两样本来自分布相同的总体,两样本的平均秩次T1/n1与T2/n2应相等或很接近,且都和总体的平均秩次(N+1)/2相差很小。含量为n1样本的秩和T1应在n1(N+l)/2(T值表范围中心为n1(N+1)/2)的左右变化,当T值偏离此值太远,发生的可能性就很小;若偏离出给定a值所确定的范围,即P<a时,拒绝H0

注:R中Wilcoxon signed rank test及Wilcoxon Mann-Whitney test可用wilcox.test进行分析,wilcox.test的具体运用方法见http://127.0.0.1:25170/library/stats/html/wilcox.test.html或help(“”)命令调用的帮助文档。

x指数据值的数字向量,y指数据值的可选数字向量需要注意的是,公式界面仅适用于两个样本的测试。如果只x给定,或如果两个x和y中给出并且paired是TRUE,一个Wilcoxon符号空的秩测试的分布x(在一个样本的情况下)或x-y(在成对的两个示例的情况下)是对称 mu的处理。否则,如果两者x并y给出了和paired是FALSE,一个Wilcoxon秩和检验(相当于Mann-Whitney检验:见注)进行。在这种情况下,原假设是的分布,x并且y通过的位置偏移而不同,mu而备选方案是通过其他的位置偏移来使分布不同(并且一侧的备选"greater"是x在的右侧移位y)。默认情况下(如果exact未指定),如果样本包含的有限值少于50个且没有关系,则计算精确的p值。否则,使用正态近似。

(三)多个样本比较的秩和检验

检验的基本步骤:

如果比较的样本多于两个,则可以用本小节的Kruskal-Wallis H检验方法。

设有k个样本,每个样本含量为img,总例数img。检验的具体步骤如下:

1.建立假设检验,确定检验水准

H0:各抽样总体分布相同;

H1:各抽样总体的分布不同或不全相同;

a=0.05。

2.计算检验统计量

(1)编秩次,将各组数据统一从小到大编秩次,对相等的数值,如果分属不同组时应取平均秩次。

(2)求秩和,分别计算各组的秩和Ti,可用关系式∑Ti=N(N+1)/2检验Ti的计算是否正确。

(3)计算H值:

当相同秩次较多时(如等级资料),采用校正的值,即:

公式中ti为相同秩次的个数。H或Hc近似服从自由度v=k-1的X2分布。按X2的界值表确定P的范围。

注:R中Kruskal-Wallis H检验通过kruskal.test()实现,其具体运用方法见https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/kruskal.test.html或 help(“”)命令调用的帮助文档。

x指数据值的数字矢量,或数字数据矢量的列表。列表中的非数字元素将被强制并带有警告。g指一个矢量或因子对象,给出对应元素的组x。需要注意的是,kruskal.testx对每个组(样本)中分布的位置参数相同的null进行Kruskal-Wallis秩和检验。另一种选择是它们至少有一个不同。如果x是列表,则将其元素作为要比较的样本,因此必须是数字数据向量。在这种情况下,将 g被忽略,并且可以简单地使用它kruskal.test(x)来执行测试。如果样品尚未包含在列表中,请使用kruskal.test[list(x,...)]。否则,x必须是数字数据向量,并且g必须是与x为的相应元素指定组的长度相同的向量或因子对象x。

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