长江，自古号称“天堑”，越接近长江，城、河、长江的关联就越发紧密。
上古时代的石头山凭江而立，滔滔江水从山脚流过，形势十分险要，因而成为兵家必争之地。所谓“石头虎踞”，指的就是石头山。六朝时期，孙权在此建石头城作为都城江防重地。
清凉山石头城
石头城雪景
唐晚期之后，石头城的军事地位不复存在，石头城渐渐成为南京文人怀古的人文胜地。唐朝几乎所有重要的诗人都到过南京，写过关于石头城的诗。而后人绘制的金陵胜景中，从“金陵八景”一直到“金陵四十八景”，“石城霁雪”都隐隐成为文人对南京城的一种解读。
江苏省美术馆副馆长、江苏省中国画学会副会长张兴来说：“金陵又叫石头城，石头城整个长度是3000米，贯穿石头城的就是秦淮河。解读南京，就是石头城和秦淮河。”
因为秦淮河水变窄，天险局势丧失，石头城在历史的车轮中渐渐衰败荒芜。不知何时开始，石头城成了一段历史，一个符号，一个名称，民间甚至误以为“鬼脸城”就是六朝的石头城。
贺云翱说：“我一直想找到石头城，因为在我做这个工作之前，人们不知道石头城在哪里，专家们有各种各样的说法。 1998年、 1999年那个时候，经过一段时间的工作，我们找到了这座城，感谢后来南京市委、市政府决定把石头城建成石头城遗址公园。”
公元924年，杨吴政权在石头城旧址兴建了第一座寺庙—— 兴教寺。
南唐先主李昪在此扩建兴教寺为石城清凉大道场，并请来文益禅师住持。文益禅师在此开创禅宗之一支“法眼宗”，由此，“石头山”更名为“清凉山”。
南唐后主李煜一度将清凉大道场作为南唐的避暑宫，在山上广植翠竹，以此清凉。据史料记载，当年宋兵围城的时候，后主李煜还在清凉寺里拜菩萨。
自此，军事要塞转变为南京的一处文化高地。金陵四十八景中的“清凉问佛”，描绘的正是清凉山佛教文化的一种盛况。
清凉寺住持理海法师说：“拜佛的人，据说，从今天的大中桥那边开始摆各种摊点，一直摆到清凉山。这个人啊真的是车水马龙，川流不息。这样一个繁荣的景观，当时应该是老百姓在古代的时候一个大的庙会，这个庙会当然涵盖了诸多的南京的文化内涵在里面。”
如今的清凉山上，还有着千年时光所留下的诸多人文印记。(www.xing528.com)
这口古井是南唐古建筑中唯一的留存，因为是南唐保大三（952）年所掘，故名“保大泉”，又被称为“还阳泉”。
理海法师说：“还阳井据历史记载，就是南唐的时候文益禅师那个时代所开凿的。据传说，人们喝这个井里面的水，能够两脉不衰，须发不白。”
“解铃还需系铃人”的成语流传很久。不过，人们很少想到，它当时就发生在南京清凉山上，是法眼宗的一句重要禅语。
宋朝《林间集》和明朝瞿汝稷《指月录》中有这样一段记载:文益住持清凉寺时，寺内有个叫泰钦的和尚，其人性情豁达，豪放不羁，且不甘于寺中清规戒律。因此，寺中众僧都瞧不起泰钦，就把一些扫地种菜的粗活派给他干。一次，文益禅师坐禅讲经，向下面僧众问道：“谁能把老虎脖子上的铃解下？”众僧面面相觑，无人能答，正好泰钦和尚走过来，应声答曰：“须原将铃系在老虎脖子上的人才能把铃解下。”文益听后，认为泰钦颇能领悟禅宗要义，此后对他器重有加。
高岑《金陵四十景图咏》之“清凉王不翠”
宋代，宰相王安石年少时曾在寺庙潜心读书。与他同时期为官的郑侠年少时也曾在清凉寺的一间小屋闭门读书。郑侠为官非常廉洁，从官场返乡时，家中只有一个拂尘掸灰。南宋宁宗嘉定十四年（1221），清凉山郑侠读书处建了一拂祠纪念他。
薛冰说：“到了明代和清代，就更显示出清凉山的文化重要地位。比如明朝的崇正书院，当时到南京来的这个督学御史，就相当于我们现在的教育厅长，他觉得南京的教育质量不过关，怎么明朝到现在没有出过状元？他就把各个书院里的尖子生召集起来，在清凉山办了这个崇正书院，他自己当老师，他来教。到了万历年间的时候，崇正书院当时的大班长焦竑就中了状元，后来南京又有一个状元叫朱之蕃，还有榜眼、探花。”
清凉山文化是多元化的，而历史的巧合又是奇妙的，从清凉山崇正书院走出来的状元朱之蕃，正是后来寄情于金陵山水，与学生陆寿栢潜心编制了“金陵四十景”的朱状元，而“金陵四十景”的第二十六景“清凉环翠”所指正是清凉山。
到了清代，画家龚贤在清凉山建造了半亩园和扫叶楼，江南才子袁枚在清凉山附近又建了随园，清凉山的文化气息更加浓厚。
为了恢复石头城—— 清凉山的文化空间，2002年4月南京市实施秦淮河环境综合整治工程，清华大学的张杰教授及其团队就在那个时候参与了外秦淮河廊道空间的建设。建设过程中，工作人员遇到了一道难题：历史上著名的“鬼脸照镜”景观，因为秦淮河水面宽水位高，鬼脸可以直接倒映在外秦淮河的水面上，如今因为防洪需要，河岸的防护高度已经使得水面无法再倒映鬼脸。
那该如何解决这个困难呢？
清华大学建筑学院教授张杰说：“在设计中，我们就想既然外秦淮河不能直接到鬼脸的石头，那么我们就想办法把这个坑变成一个新的池塘，当时就推敲在哪个地方可以看到这个鬼脸的倒影、能在新的水面里得到反映。”
在河岸的改造上，设计者们设计了上下两层的俯视河槽。底下那一层，人们可以沿着秦淮河散步，亲水近水。同时，沿着俯视河槽栽上多株柳树，大大增加了沿岸的柔美，形成了“一层水、一层堤、一层景观、一层城墙、一层山、一层城”的层层叠叠的空间效果。这种当代的景观，自然和古代又有很大不同。
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